1.缴费标准不同。深圳社保一档的缴费比例为单位缴费5.2%个人缴纳2%进入个人账户，最低缴费基数为去年月社会平均工资的60%，深圳社保二档缴费比例为单位缴纳0.6%，个人交0.2%个人账户不退费。
2、医疗保险不同，深圳社会保障医疗保险有个人账户，在所有指定医疗或社会健康可直接刷社会保障卡结算，可在12个月内申请报销门诊费用，深圳社会保障医疗保险没有个人账户，只能在绑定医院或社会健康刷社会保障卡结算，不能报销门诊费用。
3.参保条件不同。深圳社保一档只能由有深圳户口的人参保，而深圳社保二档是非深圳户口的人参保。
根据被保险人的户籍，选择深圳社保一、二档。
如果被保险人在深圳有户籍，只能选择深圳社会保障一档，如果没有各单位的个人缴费，可以选择深圳社会保障一档或二档。
如果被保险人是非深户，可以选择深圳社保的任何医保档次，但尽量不要选择三档。
如果被保险人是儿童或大学生，参加深圳社统一参加医保二档。
此外，只要参保人选择深圳社保一、二档，就必须缴纳生育保险，选择深圳社保三档不缴纳生育保险。
